鱼类代谢乙醛酸主要依赖于两种酶：乙醛脱氢酶（ALDH）和乙酰辅酶A合成酶（ACAS）。
乙醛酸是一种有毒化合物，若在代谢中不能被有效清除，就会对鱼体造成损害。因此，鱼类身体内部会通过一系列的代谢反应将乙醛酸转化成为乙醛，进而代谢掉。
首先，乙醛脱氢酶（ALDH）会将乙醛酸转化成为乙醛。随后，乙醛进入到鱼体内的线粒体中，与CoA结合生成乙酰辅酶A（Acetyl-CoA）。此时，乙酰辅酶A合成酶（ACAS）介入反应，将乙酰辅酶A转化成为鱼体需要的脂肪或糖等物质，从而完成乙醛酸的代谢过程。
需要注意的是，由于鱼类代谢乙醛酸的能力有限，而且饵料、水温、养殖密度等因素都会影响鱼体内乙醛酸的积累，所以在养殖鱼类时应当加强水质管理、控制养殖密度等方面的措施，以降低鱼体内乙醛酸的浓度。